مجالس
- مجلس الإفتاء والتجديد
- مجلس التبليغ والإرشاد
- مجلس التعليم العالي والبحوث والتطوير
- مجلس التعليم الابتدائي والثانوي والغير الرسمي
- مجلس الكوادر والموارد البشرية
- مجلس الصحة العامة
- مجلس الرعاية الاجتماعية
- مجلس الاقتصاد والتجارة والسياحة
- مجلس الأوقاف
- مجلس تمكين المجتمعات
- مجلس شؤون القوانين والحقوق الإنسانية
- مجلس حماية البيئة
- مجلس الإصدارات والإعلامات
هيئات
- هيئة المعاهد الإسلامية
- هيئة تطوير فروع الجمعية وعمارة المساجد
- هيئة الدراسة والشراكة الاستراتيجية
- هيئة التطوير والمراقبة المالية
- هيئة الإغاثة للكوارث
- هيئة إدارة الزكوات والتبرعات
- هيئة الوحدات التجارية الصغيرة والمتوسطة
- هيئة شؤون السياسة العامة
- هيئة الفنون والثقافة
- هيئة تنمية الرياضة
- هيئة العلاقات والتعاون العالمي
- هيئةالدعوة للطوائف الخاصة
- هيئة تدقيق ودراسة "حلالا طيبا"
- هيئة شؤون الحج والعمرة
- هيئة المساعدة القانونية والمناصرة العامة
مكاتب
المنظّمات المستقلّة
في سومطرة
في كاليمانتان
في جاوا
في بالي وجزر نوسا تنجارا
في سولاويسي
في جزر الملك (مالوكو) وبابوا
